Secteurs · Dermatologie & Cosmétique
Dermatologie & Cosmétique
Biologie de la peau et profilage multi-omique — transcriptomique, protéomique, métabolomique et microbiome — pour l’innovation dermo-cosmétique.
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Biologie de la peau et profilage multi-omique — transcriptomique, protéomique, métabolomique et microbiome — pour l’innovation dermo-cosmétique.
Un actif modifie la biologie de la peau ou non, et un dossier d’allégations doit dire lequel. GenXMap transforme les données de modèles cutanés 2D ou 3D et de microbiome en la preuve statistique sur laquelle repose une allégation, avec des méthodes documentées assez clairement pour être reproduites de façon indépendante.
Conçu pour le moment où une allégation doit tenir : GenXMap mobilise la multi-omique et le profilage des vésicules extracellulaires pour établir si un actif modifie la biologie de la peau, quels processus biologiques sont affectés, comment ces changements se relient entre couches moléculaires, et si l’effet est reproductible entre donneurs.
Le travail commence avant la paillasse : combien de donneurs et de réplicats biologiques sont nécessaires pour qu’un effet puisse seulement être distingué de la variabilité inter-donneurs — une question à trancher avant l’échantillonnage, pas après.
Le résultat est davantage qu’un jeu de données ou une liste de gènes différentiellement exprimés. C’est un dossier de preuve biologique multicouche et reproductible, reliant un actif à des changements mesurables de la biologie cutanée, aux voies impliquées, à la signalisation intercellulaire, et à la constance de ces effets entre donneurs.
Les méthodes avec les versions d’outils, paramètres et seuils exacts. Les figures de QC et de cohorte. Les résultats statistiques. Une interprétation écrite pour répondre à la question biologique de départ.
Conçu pour être audité ou reproduit par un tiers.
Certains actifs dermo-cosmétiques n’agissent pas par une seule voie intracellulaire. Ils peuvent modifier la communication de cellule à cellule, laissant une signature biologique non seulement dans les cellules elles-mêmes, mais aussi dans les vésicules extracellulaires qu’elles libèrent.
Saisir cette réponse demande plus que de mesurer le transcriptome cellulaire. Les vésicules doivent être isolées, caractérisées, quantifiées et leur contenu moléculaire analysé — ce qui crée une couche biologique supplémentaire, intégrable à la réponse des cellules qui les ont produites.
GenXMap combine l’analyse omique du contenu vésiculaire avec des capacités spécialisées de caractérisation des vésicules extracellulaires, développées avec la Faculté de Pharmacie de Marseille. Les populations de vésicules peuvent ainsi être caractérisées par leur taille, leur concentration et les marqueurs pertinents, tandis que leur contenu moléculaire est profilé et interprété aux côtés des données transcriptomiques et multi-omiques cellulaires.
Le résultat est une vue à deux faces de la communication cellulaire : ce qui change à l’intérieur des cellules, et ce que ces cellules communiquent à leur environnement.
En intégrant les données vésiculaires à la transcriptomique, la protéomique, la métabolomique et, le cas échéant, au profilage du microbiome, GenXMap peut déterminer si un actif produit une réponse biologique cohérente et reproductible à plusieurs niveaux de la biologie cutanée.
Pour les allégations impliquant la communication cellulaire, cela constitue une chaîne de preuve plus solide que la mesure d’un seul critère intracellulaire.
Le travail de laboratoire derrière ces analyses tourne sur OMICS4, le site plateforme de GenXMap, avec des exigences d’échantillon, une logistique et des délais définis pour chaque étude.
Mais l’analyse n’a pas à commencer dans notre laboratoire.
Nous travaillons aussi sur des données produites ailleurs. Des jeux de données transcriptomiques, protéomiques, métabolomiques, de microbiome ou de vésicules extracellulaires déjà existants — issus d’une étude antérieure, d’un programme R&D interne ou d’un autre prestataire — peuvent être analysés et intégrés pour ce qu’ils sont.
Ce qui détermine l’analyse, c’est la question biologique, le design de l’étude et les métadonnées disponibles, pas qui a produit les données ni où le séquençage a été réalisé.
Lorsque plusieurs couches omiques sont disponibles, nous les intégrons pour identifier les signaux biologiques convergents, distinguer les effets robustes de la variabilité technique ou inter-donneurs, et bâtir un dossier de preuve cohérent autour de l’allégation.
Les données peuvent venir de plateformes, de prestataires ou d’expériences différentes. La question biologique reste le point de départ.
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