Secteurs · Dermatologie & Cosmétique
Dermatologie & Cosmétique
Biologie de la peau et profilage multi-omique (transcriptomique, protéomique, métabolomique et microbiome), pour l’innovation dermo-cosmétique.
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Biologie de la peau et profilage multi-omique (transcriptomique, protéomique, métabolomique et microbiome), pour l’innovation dermo-cosmétique.
Vous voulez étayer vos allégations produit par une preuve moléculaire ? Du modèle à l’interprétation, Skin Biology Xplorer montre comment vos cellules, explants ou modèles 3D répondent à un composé, quelles voies biologiques sont impliquées, et ce que cela dit de son mécanisme d’action.
Expression différentielle entre conditions traitée et non traitée, au niveau des gènes et des voies, avec tailles d’effet et significativité rapportées pour chaque comparaison.
Quantification au niveau protéique et abondance différentielle, confrontées au résultat transcriptomique. Panels ciblés lorsqu’un candidat demande confirmation.
Isolement des vésicules, distribution de taille et comptage de particules, avec un contenu moléculaire profilé aux côtés des cellules qui l’ont libéré. Pour les actifs qui agissent sur la communication de cellule à cellule plutôt que par une seule voie intracellulaire.
Composition de la communauté cutanée avant et après traitement, lorsque l’allégation implique le microbiome.
Couches mesurées sur les mêmes échantillons et lues ensemble, de sorte qu’un signal observé dans plusieurs d’entre elles pèse davantage qu’un signal vu dans une seule mesure.
Effet donneur estimé et séparé de l’effet traitement, car un actif qui agit sur trois donneurs sur huit n’est pas le même résultat qu’un actif qui agit sur les huit.
Le protocole est fixé au début d’une série de formulations et maintenu tout au long, de sorte qu’une différence entre itérations est une différence de formulation, et non de mesure.
Versions d’outils, paramètres et seuils pour chaque étape. QC par échantillon et par cohorte, avec exclusions énoncées et justifiées. Interprétation écrite au regard de la question de départ de l’étude, en disant ce que les données soutiennent et ce qu’elles ne soutiennent pas. Matrices traitées, tables de résultats, pipelines versionnés et figures, livrés pour audit ou reproduction par un tiers.
Combien de donneurs et combien de réplicats faut-il pour qu’un effet puisse seulement être distingué de la variabilité inter-donneurs : cette question doit être tranchée avant l’échantillonnage, pas après. Une étude qui ne peut pas séparer les deux produira des données, mais pas une preuve.
Certains actifs dermo-cosmétiques n’agissent pas par une seule voie intracellulaire. Ils modifient ce que les cellules se communiquent entre elles, et cette signature apparaît non seulement dans les cellules, mais aussi dans les vésicules extracellulaires qu’elles libèrent.
Mesurer le seul transcriptome cellulaire passe à côté. Les vésicules doivent être isolées, comptées, dimensionnées et leur contenu analysé, ce qui ajoute une couche que l’on peut ensuite lire avec la réponse des cellules qui les ont produites.
GenXMap combine l’analyse omique du contenu vésiculaire avec des capacités spécialisées de caractérisation des vésicules extracellulaires, développées avec la Faculté de Pharmacie de Marseille. Les populations de vésicules peuvent ainsi être caractérisées par leur taille, leur concentration et les marqueurs pertinents, tandis que leur contenu moléculaire est profilé et interprété aux côtés des données transcriptomiques et multi-omiques cellulaires.
Le résultat est une vue à deux faces de la communication cellulaire : ce qui change à l’intérieur des cellules, et ce que ces cellules communiquent à leur environnement.
En intégrant les données vésiculaires à la transcriptomique, la protéomique, la métabolomique et, le cas échéant, au profilage du microbiome, GenXMap peut déterminer si un actif produit une réponse biologique cohérente et reproductible à plusieurs niveaux de la biologie cutanée.
Pour les allégations impliquant la communication cellulaire, cela constitue une chaîne de preuve plus solide que la mesure d’un seul critère intracellulaire.
Le travail de laboratoire derrière ces analyses tourne sur OMICS4, le site plateforme de GenXMap, avec des exigences d’échantillon, une logistique et des délais définis pour chaque étude.
L’analyse n’a pas à commencer là. Des données transcriptomiques, protéomiques, métabolomiques, de microbiome ou de vésicules extracellulaires issues d’une étude antérieure, d’un programme interne ou d’un autre prestataire peuvent être analysées pour ce qu’elles sont. Ce qui détermine l’analyse, c’est la question biologique, le design de l’étude et les métadonnées disponibles.
Lorsque plusieurs couches sont disponibles, nous les intégrons pour trouver les signaux convergents, séparer les effets robustes de la variabilité technique ou inter-donneurs, et construire la preuve autour de l’allégation.
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