Ressources

Études de cas & rapports types

Un aperçu de la façon dont GenXMap transforme des données de séquençage brutes en un rapport scientifique documenté et exploitable : méthodes, figures et interprétation inclus.

Études de cas

Études de cas & rapports types

Des projets GenXMap réels, des données brutes à l'interprétation biologique : méthodologie complète incluse. De nouvelles études sont ajoutées au fur et à mesure de l'avancement des projets.

Figure d'enrichissement des voies KEGG issue de l'étude de cas sur la cicatrisation cutanée
Étude de cas · Dermo-cosmétique

Un actif dermo-cosmétique remodèle le transcriptome de cicatrisation d'explants de peau

Bulk RNA-seq sur 24 explants de peau ex vivo : QC, PCA, expression différentielle et enrichissement fonctionnel, des lectures brutes à l'interprétation biologique.

Bientôt disponible

D'autres études de cas en préparation

D'autres rapports en immuno-oncologie, médecine de précision et maladies infectieuses seront publiés ici au fur et à mesure de l'avancement des projets.

Blog & actualités

Blog & actualités

Notes de méthodologie, mises à jour de la plateforme et actualités des programmes R&D de GenXMap : publication à venir.

Bientôt disponible

Premiers articles en préparation

Notes de méthodologie, mises à jour de la plateforme et actualités R&D seront publiées ici dès qu'elles seront prêtes.

FAQ

Questions fréquentes

Les questions les plus courantes avant de démarrer un projet. Vous ne trouvez pas la vôtre, écrivez-nous directement.

Quels types d'échantillons traitez-vous ?

Sang, tissus, cellules, FFPE, salive, plasma, selles, bactéries et explants de peau, entre autres : la préparation et l'extraction des échantillons sont optimisées selon le type d'échantillon. Indiquez-nous ce dont vous disposez et nous confirmerons la faisabilité.

Existe-t-il une taille minimale d'échantillon ou de projet ?

Pas de minimum fixe : chaque projet est cadré individuellement, d'une simple étude pilote à un partenariat de recherche pluriannuel. Indiquez-nous votre volume d'échantillons et votre question biologique, et nous confirmerons ce qui est réalisable.

Prenez-vous en charge le séquençage single-cell autant que le bulk ?

Oui. Notre plateforme Génomique & Multi-Omics couvre à la fois le RNA-seq bulk et single-cell, ainsi que le séquençage du génome entier, de l'exome entier et le séquençage ciblé.

Combien de temps dure un projet type ?

Le délai dépend de la plateforme et du volume d'échantillons, et il est confirmé en amont lors du cadrage. Sur l'ensemble de nos projets réalisés, 95 % sont livrés dans les délais convenus.

Que recevons-nous à la fin d'un projet ?

Un rapport documenté et exploitable pour la décision : indicateurs qualité, figures, résultats statistiques et interprétation biologique, ainsi que les données brutes et traitées. Des tableaux de bord interactifs sont disponibles sur demande, en plus d'un simple PDF statique.

Pouvez-vous réaliser le wet-lab et l'analyse computationnelle séparément ?

Oui. OMICS4, propulsée par GenXMap, couvre indépendamment les plateformes wet-lab (traitement des échantillons, biologie moléculaire, génomique & multi-omics, imagerie). L'équipe Computational Biology & AI de GenXMap peut également analyser des données que vous avez générées ailleurs.

Pouvez-vous ré-analyser des données que nous avons déjà générées ailleurs ?

Oui. Notre équipe Computational Biology & AI peut reprendre vos fichiers FASTQ ou toute autre donnée déjà traitée pour y appliquer des analyses complémentaires, un contrôle qualité ou une intégration multi-omics.

Travaillez-vous avec des laboratoires académiques autant qu'avec des partenaires industriels ?

Oui, laboratoires académiques et hospitaliers, équipes biotech et pharma, et groupes de recherche translationnelle. Consultez Recherche Collaborative pour voir comment nous nous adaptons à chacun.

Acceptez-vous des échantillons en provenance de l'étranger ?

En général, oui : indiquez-nous votre type d'échantillon et son pays d'origine, et nous confirmerons la logistique d'expédition ainsi que les éventuelles exigences d'importation avant tout envoi.

Devons-nous signer un accord de confidentialité avant d'obtenir un devis ?

Nous signons volontiers un accord de confidentialité mutuel avant de discuter des spécificités du projet. Il suffit de nous le demander lorsque vous nous écrivez.

Nos données et notre propriété intellectuelle restent-elles confidentielles ?

Oui. Les projets sont couverts par des accords de confidentialité mutuels, et le traitement des données suit des pratiques de sécurité de niveau entreprise à chaque étape.

Comment obtenir un devis ou démarrer un projet ?

Écrivez-nous en précisant votre type d'échantillon et votre question biologique. Nous vous recommanderons la ou les plateformes adaptées et vous transmettrons un devis.