Chaîne GenXMap : échantillons et wet lab, génération de données multi-omiques, bio-informatique et IA, insight biologique

À propos de GenXMap

Une seule équipe, de l'échantillon à l'insight biologique

GenXMap est né d'un constat simple : le wet lab et la biologie computationnelle fonctionnent souvent comme deux mondes séparés, gérés par des prestataires différents qui ne partagent pas le contexte. Nous réunissons wet lab, multi-omics, bioinformatique et IA dans une seule équipe, pour que chaque décision analytique soit prise avec la vision complète du projet : pas seulement le fichier qui a été transmis.

Conçu autour de la question biologique

La recherche biologique s’est scindée en trois métiers : le travail expérimental, la production de données moléculaires et l’analyse computationnelle. Une étude peut passer par plusieurs laboratoires, un prestataire de séquençage et une équipe d’analyse, chaque étape techniquement solide, et perdre malgré tout son contexte biologique entre les deux.

GenXMap a été bâti pour tenir les trois ensemble — du design de l’étude et du traitement des échantillons jusqu’à la caractérisation moléculaire, l’analyse et l’interprétation — pour qu’un programme produise une preuve cohérente, et non une collection de jeux de données.

Notre histoire

Comment l’entreprise s’est construite

Pourquoi la question vient d’abord

Une question biologique se ramène rarement à une seule technologie. Nous concevons le workflow autour de ce qu’il faut comprendre, mesurer ou comparer, et nous choisissons la plateforme ensuite.

Comprendre une réponse au traitement

Peut demander des données génomiques, transcriptomiques et protéomiques lues ensemble, plutôt qu’une couche prise pour le tout.

Étudier une infection

Peut demander la génomique du pathogène, la réponse de l’hôte et le microbiote, parce que la réponse est dans l’interaction et non d’un seul côté.

Séquençage, protéomique, single-cell, approches spatiales et modèles computationnels sont des outils ; leur valeur tient à répondre à une question avec le bon niveau de preuve.

Ce à quoi nous tenons

Principe 01

La biologie reste reliée

Le design façonne les données, les données déterminent l’analyse, et l’analyse reste liée au contexte biologique, dans un seul workflow plutôt qu’en livrables séparés.

Principe 02

Les preuves convergent

Nous intégrons les couches moléculaires pertinentes pour voir si les signaux pointent vers le même processus biologique, et nous séparons les effets biologiques de la variabilité inter-donneurs, de la variation technique et des résultats isolés.

Principe 03

La science reste traçable

Méthodes, paramètres, versions logicielles, seuils et décisions clés sont documentés de bout en bout, pour que les résultats puissent être compris, contestés et reproduits.

Marseille, et le réseau autour

GenXMap a été fondée à Marseille en 2020. Depuis 2024, ses laboratoires opèrent dans l’environnement de l’IHU Méditerranée Infection, au contact de la recherche clinique et translationnelle. Ce que nous ne gardons pas en interne, nous le réalisons via des partenaires spécialisés choisis, sous notre propre design d’étude et notre coordination : le client n’a affaire qu’à une seule équipe. A5 Science apporte la microscopie à force atomique sur particules biologiques en milieu liquide, pour le programme de R&D interne.

Nous travaillons avec des institutions académiques, des biotechs et des équipes de R&D industrielles sur six secteurs, pour des études qui vont d’une analyse moléculaire unique à un programme intégré pluriannuel.

Voir les six secteurs que nous servons

Écosystème

Le réseau sur lequel GenXMap s’appuie

Clusters, institutions d’accueil, financeurs, réseaux professionnels et partenaires privés spécialisés. Dépliez une catégorie pour voir qui la compose.

Clusters et biopôles04

GenXMap est membre d’Eurobiomed et de France Biotech, et rejoint le Paris-Saclay Cancer Cluster et le Marseille Immunology Biocluster.

EurobiomedFrance BiotechParis-Saclay Cancer ClusterMarseille Immunology Biocluster
Institutions d’accueil et plateaux académiques02

Les laboratoires opèrent dans l’environnement de l’IHU Méditerranée Infection, aux côtés des plateaux de génomique et de génétique médicale du site marseillais.

IHU Méditerranée InfectionMarseille Medical Genetics
Financement et soutien à l’innovation05

Le développement de GenXMap a été soutenu par Bpifrance (2024, 2026), la Région Sud (2025, 2026), RisingSUD, Business France et le programme Orange Femme Entrepreneuse (2025), avec l’appui bancaire et d’accompagnement de la CEPAC, du CIC et d’IODA Consulting. GenXMap est aussi lauréat France 2030, via le dispositif PIA4 régionalisé.

BpifranceFrance 2030Région SudCEPACCIC
Réseaux et adhésions03

Réseaux professionnels et associations de filière qui relient GenXMap à la communauté des sciences du vivant.

AFSSI Sciences de la VieMarseille InnovationMy Biologics Partner
Partenaires privés spécialisés07

Ce que nous ne gardons pas en interne, nous le réalisons via des partenaires spécialisés choisis, sous notre propre design d’étude et notre coordination : le client n’a affaire qu’à une seule équipe.

CTI BiotechDIVA ExpertiseG.CLIPS BiotechPKDERMParean BiotechnologiesExplicyteA5 Science

Échantillons et données

Comment vos échantillons et vos données sont traités

Défini par étude, inscrit au contrat, et identique quel que soit qui tient la paillasse.

01

Consentement et bioéthique

Les échantillons d’origine patient et cliniques sont traités sous le cadre de consentement et de bioéthique applicable à chaque étude.

02

Où vivent les données

Traitées en France et ailleurs dans l’Union européenne, selon la sensibilité des données et la demande du client.

03

RGPD, dans tous les cas

Sans exception, quelle que soit la plateforme ou le partenaire qui réalise la mesure.

04

Accès et conservation

Accès contrôlé par projet ; durée de conservation fixée par le contrat d’étude.

De la question à la décision

01

Question biologique

Ce qu’il faut comprendre, mesurer ou comparer.

02

Design de l’étude

Plateformes et contrôles choisis après la question, pas avant.

03

Caractérisation moléculaire

Le wet lab, sous une seule coordination.

04

Analyse et intégration

Les couches lues ensemble, pas réconciliées après coup.

05

Interprétation

La preuve pour la prochaine décision R&D.

Une question biologique ?

Parlez-nous du projet, des échantillons et de ce que vous avez besoin de comprendre.

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