Programme 01 · Recherche interne
Toutes les méthodes de RNA-seq en cellule unique utilisées en routine aujourd'hui commencent de la même façon : la cellule est lysée. C'est un instantané destructif, à usage unique. GenXMap développe une méthode d'omique de la cellule unique vivante pour lire l'état transcriptomique d'une cellule intacte et vivante, ouvrant la voie à une véritable cinétique à résolution unicellulaire.
La transcriptomique en cellule unique a transformé la biologie, mais chaque protocole établi détruit la cellule pour la lire. Cela signifie qu'on obtient un seul point temporel par cellule, à jamais : pas de nouveau prélèvement, pas de cinétique, aucun moyen d'observer une même cellule changer d'état puis de confirmer ce qu'elle est devenue. Pour les questions biologiques qui se déploient dans le temps (une cellule répondant à un médicament, un clone rare dérivant vers la résistance, une cellule immunitaire se différenciant) cette limite du prélèvement unique est le plafond.
Cellule isolée → lysée → ARN capturé → séquencé. Destructive par conception. Chaque point temporel nécessite une nouvelle cellule distincte, et l'inférence au niveau de la population se substitue à une véritable cinétique en cellule unique.
Une méthode pour extraire le signal transcriptomique d'une cellule unique vivante sans lyse : préservant sa viabilité afin que la même cellule puisse être mesurée à nouveau, suivie, ou récupérée pour un usage en aval.
Supprimer l'étape de lyse ne préserve pas seulement un échantillon. Cela change les questions auxquelles on peut répondre. Les données longitudinales en cellule unique, les mesures appariées avant/après sur la même cellule, et les tests fonctionnels en aval sur des cellules déjà « lues » deviennent pour la première fois possibles à résolution unicellulaire.
Un programme de recherche interne pluriannuel, qui va de premiers travaux de faisabilité à la validation puis, à terme, à l'intégration dans la plateforme GenXMap. Nous ne communiquons pas publiquement le détail de l'avancement du programme tant que les discussions de propriété intellectuelle et de partenariat sont en cours, contactez-nous pour un point plus approfondi sous accord de confidentialité.
Ce programme est soutenu par des financements publics à l'innovation et par l'écosystème biotech marseillais, reflet de la valeur scientifique et stratégique accordée à l'omique non destructive en cellule unique en tant que future infrastructure de recherche.
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